Основным структурным подразделением ГГФ, как части образовательного учреждения (ТГУ), является кафедра.

Кроме кафедр (их девять), в составе факультета функционируют общефакультетские подразделения (деканат, ГИС–лаборатория, УМЦ «Геоинформ», НИЛ Геокарт).