Это направление, специализирующееся на изучении ультамафитов и мафитов различных формационных типов Сибирского и смежного регионов, создано профессором А.И. Гончаренко и продолжает развиваться под руководством профессора А.И. Чернышова. Исполнители - А.И. Чернышов, Ю.В. Уткин, И.Ф. Гертнер, А.А. Возная, И.Г. Тарасенко, Е.Е. Пугачева, О.В. Бетхер, П.А. Тишин, Т.С. Краснова, А.Н. Юричев, А.С. Кульков, А.В. Кичеева. В рамках направления ведется активное сотрудничество с учеными ОИГГиМ СО РАН (г. Новосибирск: В.В. Велинский, Ф.П. Леснов, В.А. Симонов, С.И. Ступаков), институтом Геохимии СО РАН (г. Иркутск: О.М. Глазунов, А.С. Механошин), ИГиГ УрО РАН (г. Екатеринбург: В.Р. Шмелев), с Камчатским экологическим центром (Е.Г. Сидоров).

Руководитель — доцент И.Ф. Гертнер. В рамках темы, посвященной изучению щелочного и щелочно–ультраосновного магматизма СЗ Сибирской платформы и Кузнецкого Алатау, активно работают сотрудники НИЛ СПМ В.В. Врублевский и Т.С. Краснова. Доцентом И.Ф. Гертнером установлены тесные контакты с сотрудниками СПГГУ и ВСЕГЕИ (г. Санкт–Петербург; Рамонского научного центра университета Бен–Гурион (Израиль) и Департамента геологии Университета Саламанка (Испания), с которыми проведены совместные полевые работы по оценке золотоносности тектоно–магматических комплексов Тянь–Шаня. Под его руководством проведены экспедиционные работы в Монголии, финансируемые Австралийско–Киргизской компанией “Elayne Nominees”.

Руководитель — доцент О.В. Бетхер, исполнители - И.В. Вологдина, М.И. Шаминова, Ю.В. Уткин, Л.А. Краснощекова, Г.Г. Кравченко, А.И. Кудаманов. Тематика работ проводится при активном сотрудничестве с палеонтологическим центром ТГУ, а также сотрудниками ТПУ и нефтедобывающими компаниями.