Уже в декабре 1888 года в университете была устроена первая естественноисторическая выставка, где демонстрировались первые минералы коллекции музея. Фонды музея насчитывают свыше 50 тысяч образцов. Музей располагает экспозиционным залом площадью 170 кв. метров. Гордостью музея являются исторические коллекции образцов минералов конца XIX начала XX века, связанные с именами известных ученых, горных инженеров, золотопромышленников, таких как А.М. Зайцев, П.П. Пилипенко, В.А. Обручев, П.П. Иванов, а также подаренные Фрайбергской горной академией, известной фирмой «Д-р Кранц». Золотым фондом музея являются коллекции, собранные многолетними экспедициями преподавателей и студентов университета. Львиная часть этих полевых исследований пришлась на азиатский материк, а точнее на его внутреннюю область, где расположен гигантский и сложнопостроенный Центрально-Азиатский складчатый пояс, объединивший многочисленные хребты Алтая, Саян, Кузнецкого Алатау, Восточного и Западного Тануола, Монголии и Забайкалья. Сегодня музей содержит богатейшие коллекции минеральных образцов десятков месторождений данного пояса.

В своей речи при открытии университета попечитель Западно-Сибирского учебного округа В.М. Флоринский подчеркнул: «Относительно учебных и научных пособий Томский государственный университет может считать себя особенно счастливым. Люди, близко принимающие к сердцу потребности высшего просвещения, помогли ему подготовить к открытию учебных курсов богатые коллекции по многим отраслям естествознания. Благодаря им, естественно-исторические музеи нашего университета в первый же год своего существования поставлен в такое положение, что учащие и учащиеся могут найти в них достаточные пособия для научных занятий».

Экскурсии в музей проводились по воскресным дням в течении всего учебного года. Число посетителей, принадлежавшим к разным слоям общества колебалось от 50 до 200 человек в день.

Уже в декабре 1888 года в университете была организована первая научная выставка, на которой демонстрировались коллекции горных пород, минералов, палеонтологические коллекции, коллекция зоологическая, ботаническая, она произвела большое впечатление на посетителей и стала своеобразной формой взаимодействия университета с местным обществом, частью культурной жизни университетского города и региона.

Минералогический музей стал первым на территории Сибири специализированным собранием руд минералов, горных пород, окаменелых остатков древних животных и растений, а его основатель А.М. Зайцев приложил немало усилий для развития своего детища. На протяжении шестнадцати лет, начиная с 1889 года, он каждое лето проводил научные экспедиции, изучая геологическое строение окрестностей Томска, Кузнецкого Алатау, Хакасии, Алтая, Урала, пополняя тем самым фонды музея. Им было собрано около 4000 штуфов. Кроме того профессор А.М. Зайцев, выезжая за границу с целью знакомства преподавания там минералогии, приобретал также для музея новые коллекции минералов. Им были приобретены образцы минералов многих зарубежных месторождений и знаменитой фирмы «Д-р Кранц».

Огромную помощь А.М. Зайцеву в пополнении фондов музея оказывали хранители музея А.Н. Державин и П.П. Пилипенко. А.Н. Державин, исполняя обязанности хранителя музея с 1888 по 1901 годы, проводил научные экспедиции в пределах Томской губернии, собрал и доставил в музей 1980 образцов минералов и горных пород.

Огромное внимание развитию и процветанию музея оказывали и оказывают преподаватели кафедры минералогии и геохимии, а также выпускники и сотрудники геолого-географического факультета, которые в результате многолетних экспедиционных работ систематически пополняли и пополняют фонды музея ценными коллекциями. Это минералы и руды полиметаллических месторождений Рудного Алтая, железорудных объектов Алтае-Саянской области, оловорудных и полиметаллических месторождений Средней Азии и Дальнего Востока, редкометальных пегатитовых полей Монголии, Памира, Енисейского кряжа, Тувы и др. И здесь необходимо прежде назвать нынешнего заведующего кафедрой минералогии и геохимии Коноваленко С.И., передавшего музею большое количество уникальных образцов, в том числе двух вновь открытых им минералов тусионита и ташелгита, а также впервые найденных на территории бывшего СССР, виитаньемита, стибиоколумбита, тетравирмикита, геландита и многих других. Свой вклад в пополнение коллекций музея в разные годы внесли Б.М. Тюлюпо, А.И. Летувнинкас, В.А. Баженов, Г.М. Татьянин, Л.А. Зырянова, В.Л. Свешникова, А.Д. Бабанский, Ю. В. Уткин, В.Г. Родыгина, А.И. Родыгин, П.В. Осипов, А.А. Егоров, Г.Б. Князев, А.Д. Строителев, А.И. Чернышев, А.В. Маноева, Н.Н. Борозновская, В.Е. Хохлов, И.И. Матросов, В.М. Яковлев, Л.И. Шабалин и многие, многие другие.

В последнее десятилетие фонды музея пополнились уникальными коллекциями минералов Монголии и Киргизии, собранными во время научных экспедиций сотрудниками и студентами кафедры минералогии и геохимии С.И. Коновалнко, А.А. Баевой, О.В. Бухаровой, Зениной К.С., Герасимовым В.К. В 2011 году сотрудники кафедры и музея Л.А. Зырянова, С.И. Коноваленко, В.Л. Свешникова выезжали на скарновые полиметаллические и боросиликатные месторождения Дальнегорского рудного поля. Собранные ими образцы этого удивительного коллекционного рая также украшают сегодня экспозиции музея.

Большую коллекцию новых и редких минералов (около 50 образцов) собранную в разные годы (1996-2009 гг), главным образом из месторождений Кольского полуострова, в 2011 году подарил музею сотрудник МГУ доктор г-м-н И.В. Пеков.

Уникальные коллекционные образцы минералов из зоны окисления Рубцовского полиметаллического месторождения куприта, самородной меди, азурита, марШита были предоставлены в музей выпускниками геолого-географического факультета А.А. Тишеловичем, Н.Д. Литвиновым, В.И. Чурсиновым, Ю.В. Васильевым, Л.А. Зыряновой, О.М. Гриневым.

Минералогический музей является гордостью не только факультета, но и университета. Музей всегда выполнял свою главную функцию – учебную и научно-просветительскую. Сохранение, экспанирование коллекций музея является важной миссией университетского музея. Уже с открытия музея была предусмотрена должность хранителя музея, которую в разные годы исполняли А.Н. Державин, А.В. Емельянов, П.П. Пилипенко, Красненькая Т.Е. и Кузнецов Ю.А., который был принят временно исполняющим хранителем музея с 20 ноября 1924 (согласно приказу ТГУ №308 от 17 ноября 1924 г) и проработал до 1925года. Затем должность хранителя музея из штата исчезла.

Обязанности заведующего минералогическим музеем со дня его открытия исполняли вначале заведующие кафедрой минералогии и геологии, а в 1944 году на должность заведующего музеем была принята выпускница 1944 года геолого-почвенного факультета Кочетова М.А., проработавшая до 1950 года, затем Родыгина В.Г. (1950-1954гг), Булынников В.А. (1954-1957), Индукаев Ю.В. (1957-1958), Калинин Д.В. (1958-1959гг), Строителев А.Д. (1959-1972гг), Зырянова Л.А. (1972-1973гг), Свешникова В.Л (1973 г-2021).

В настоящее время фонды музея насчитывают свыше 30 тыс. образцов. Они представляют 700 минеральных разновидностей минерального царства. Коллекции музея систематизированы по принятой научной классификации. Они имеют важное учебно-вспомогательное значение и постоянно востребованы в классических формах учебного процесса (лекции, практические занятия) курсов: «Минералогия», «Минералогия ювелирного камня», «Минералогия руд», «Геология месторождений полезных ископаемых», «Биоминералогия».

Наиболее значительна по объему систематическая коллекция, представляющая собрание минералов по следующим классам:

• самородные элементы;
• сульфиды и их аналоги;
• галоидные соединения;
• оксиды, гидрооксиды;
• кислородные соли;
• силикаты.

Практически не уступает ей по объему коллекция рудных и нерудных месторождений. Она формировалась в разные годы преподавателями и студентами геолого-географического факультета, выезжавшими в экспедиции в тот или иной регион страны. Большую помощь в ее комплектации им оказывали и оказывают выпускники, работающие в геологических организациях России и стран ближнего зарубежья. Наиболее полно в экспозиции представлены минералы Кольского полуострова, Урала, Рудного Алтая, Горного Алтая, Дальнего Востока и Приморья, Казахстана, Якутии, Средней Азии, Памира, Монголии.

Коллекции музея широко используются в научно-исследовательской работе студентов, которые под руководством сотрудников кафедры минералогии и геохимии и заведующей музеем выполняют курсовые работы, бакалаврские и магистерские диссертации. Фонды музея используются также при подготовке кандидатских и докторских диссертаций. На базе музея ежегодно проводятся курсы повышения квалификации в области геммологии для сотрудников различных государственных учреждений, организуются и проводятся конференции по геммологи, в которых участвуют специалисты России и стран ближнего зарубежья.

К минералогическим коллекциям музея обращаются не только студенты и сотрудники геолого-географического факультета, но и других факультетов университета, а также других вузов города.

Образовательная деятельность музея неразрывно связана с просветительской работой. Частыми гостями в стенах университета и музея являются учащиеся школ, гимназий Томска, а в дни школьных каникул и соседних городов и сел. Занимательные рассказы о минералах всегда привлекают и пользуются большим интересом у посетителей (школьники, студенты, аспиранты, сотрудники, зарубежные гости), о чем свидетельствуют записи в книге учета посетителей.

Экспозиции музея размещены в одном обширном зале площадью 170м2, выставлены в деревянных шкафах-витринах, которыми был оборудован музей во время открытия и только центральный ряд зала представлен витринами из стекла и металла, в котором выставлены нарядные, сверкающие самоцветы, всегда привлекающие внимание гостей.

Богатые фонды минералогического музея несут ценнейшую информацию, накопленную за 125-летний период его существования. Они позволяют посредством экспозиций, экскурсий, выставок, лекций популяризировать геологическое знание, проводить профориентацию школьников, воспитывать у молодежи любовь к родной природе.

Текст: В.Л. Свешникова; оформление Зенина К.С.